ＪＲ東日本の公式ホームページに新型コロナウイルスの影響によりキャンセル（旅行を見合わせる）場合等についての払い戻しについて掲載されています。
通学定期についてご参考までに記載します。通勤定期については、特別措置はないようです。
新型コロナウイルスの影響により、文部科学省より全国の教育委員会などに対し、全国の小中学校、高校、特別支援学校を 2020 年３月２日から臨時休業するよう要請する通知が発出されました。これに伴い、通学先の学校が休校となったため、対象となる通学定期券（新幹線定期券「FREX パル」を含みます。）を払いもどしされる方が対象とのこと。
今のところ確認したところでは、相鉄線、小田急線、東京メトロ等、各社でリリースを出しています。
ご参考までに、下記JR東日本のものです。
詳しくは、下記の公式サイトで確認ください。トップページに記載されています。
